Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB1P98172 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms