Protein–RNA interactions for Protein: P80723

BASP1, Brain acid soluble protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BASP1P80723 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BASP1P80723 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BASP1P80723 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BASP1P80723 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BASP1P80723 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BASP1P80723 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BASP1P80723 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BASP1P80723 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BASP1P80723 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BASP1P80723 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms