Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LMO4P61968 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LMO4P61968 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LMO4P61968 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMO4P61968 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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