Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms