Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ABCE1P61221 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms