Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NME5P56597 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME5P56597 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME5P56597 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME5P56597 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME5P56597 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME5P56597 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms