Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTCP1P56278 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTCP1P56278 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms