Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP9P55211 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP9P55211 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP9P55211 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms