Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RORCP51449 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RORCP51449 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RORCP51449 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms