Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP2P50120 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP2P50120 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms