Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PXNP49023 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PXNP49023 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PXNP49023 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PXNP49023 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PXNP49023 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms