Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCLMP48507 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GCLMP48507 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GCLMP48507 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GCLMP48507 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GCLMP48507 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms