Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP5OP48047 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP5OP48047 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5OP48047 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms