Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP5P45974 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP5P45974 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP5P45974 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms