Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AFMP43652 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AFMP43652 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AFMP43652 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AFMP43652 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms