Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRATP43155 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRATP43155 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRATP43155 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRATP43155 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRATP43155 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRATP43155 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRATP43155 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRATP43155 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRATP43155 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms