Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTGER3P43115 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms