Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIA2P42262 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIA2P42262 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms