Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJC1P36383 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJC1P36383 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms