Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTNNB1P35222 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTNNB1P35222 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms