Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFNP31947 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFNP31947 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFNP31947 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFNP31947 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms