Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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CASQ1P31415 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CASQ1P31415 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CASQ1P31415 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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