Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC104113.1-201ENST00000607723 479 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CIB4-201ENST00000288861 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NPHP1-205ENST00000418527 742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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HOXD11P31277 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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HOXD11P31277 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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HOXD11P31277 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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HOXD11P31277 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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HOXD11P31277 CASC9-201ENST00000504531 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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HOXD11P31277 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 GTF2B-201ENST00000370500 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 AC009061.2-203ENST00000635000 1462 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD11P31277 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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