Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD34P28906 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD34P28906 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD34P28906 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD34P28906 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD34P28906 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms