Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PEX2P28328 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PEX2P28328 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms