Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXP28300 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXP28300 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXP28300 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXP28300 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXP28300 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXP28300 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXP28300 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms