Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTR2AP28223 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms