Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGB2P26583 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms