Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXCR1P25024 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms