Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK2P24941 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK2P24941 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK2P24941 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK2P24941 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDK2P24941 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms