Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP5F1P24539 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms