Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USF1P22415 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USF1P22415 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USF1P22415 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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