Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZKSCAN1P17029 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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