Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB3P14651 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms