Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLA-DOBP13765 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms