Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GP1BBP13224 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms