Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT3P12035 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT3P12035 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms