Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HKR1P10072 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HKR1P10072 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms