Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB7P09629 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB7P09629 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms