Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMBP08118 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMBP08118 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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MSMBP08118 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMBP08118 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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