Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTAP01374 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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LTAP01374 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LTAP01374 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LTAP01374 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LTAP01374 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LTAP01374 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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