Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F6O75461 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms