Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP4O75379 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms