Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms