Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VGFO15240 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VGFO15240 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VGFO15240 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VGFO15240 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VGFO15240 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VGFO15240 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGFO15240 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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