Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms