Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B4DXG7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B4DXG7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B4DXG7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms