Protein–RNA interactions for Protein: B4DJY2

TMEM233, Transmembrane protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM233B4DJY2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM233B4DJY2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM233B4DJY2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms