Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms