Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TVP23AA6NH52 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms